Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms