Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA1CQ9BQE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms