Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL4Q9BPW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOL4Q9BPW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms