Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC6Q96SB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC6Q96SB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms