Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3IPQ96QF0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IPQ96QF0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.8 ms