Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3Q96PU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF3Q96PU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms