Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAP1Q96NZ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAP1Q96NZ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAP1Q96NZ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms