Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC7Q96NW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC7Q96NW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC7Q96NW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms