Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00167Q96N53 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00167Q96N53 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00167Q96N53 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms