Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ROBO3Q96MS0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms