Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGD4Q96M96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FGD4Q96M96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms