Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf72Q96LT7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms