Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EP400Q96L91 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EP400Q96L91 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EP400Q96L91 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms