Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD3Q96L08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD3Q96L08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms