Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPIP1Q96JH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPIP1Q96JH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms