Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHDQ96IW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHDQ96IW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHDQ96IW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms