Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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FAM46AQ96IP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FAM46AQ96IP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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FAM46AQ96IP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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FAM46AQ96IP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FAM46AQ96IP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM46AQ96IP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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FAM46AQ96IP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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