Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP2Q96HF1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFRP2Q96HF1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms