Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBGCP3Q96CW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.4 ms