Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD1Q96CP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD1Q96CP7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms