Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC45Q96CN5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC45Q96CN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC45Q96CN5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms