Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSUN4Q96CB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSUN4Q96CB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSUN4Q96CB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms