Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTAQ92696 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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RABGGTAQ92696 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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