Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 DCS2YOR173W 1062 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1B-ORQ92393 RPL15BYMR121C 615 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1B-ORQ92393 YIF1YNL263C 945 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 PSH1YOL054W 1221 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 CIN5YOR028C 888 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 snR19snR19 568 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 AZR1YGR224W 1842 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 NMA1YLR328W 1206 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 RPS19BYNL302C 435 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SMF3YLR034C 1422 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 STB5YHR178W 2232 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 APS1YLR170C 471 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 STB3YDR169C 1542 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 KIP2YPL155C 2121 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SWI1YPL016W 3945 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 MEU1YLR017W 1014 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SNU71YGR013W 1863 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 ATG20YDL113C 1923 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SUP56tL(CAA)A 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SUP53tL(CAA)C 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SUP54tL(CAA)G2 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 NIT2YJL126W 924 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 NAG1YGR031C-A 492 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 YHR140WYHR140W 720 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 PCL1YNL289W 840 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 IDP1YDL066W 1287 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 ERD1YDR414C 1089 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 YML6YML025C 861 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 ELC1YPL046C 300 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 HRR25YPL204W 1485 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 SEC12YNR026C 1416 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 ECM3YOR092W 1842 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 CCR4YAL021C 2514 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1B-ORQ92393 GEX1YCL073C 1848 nt7.65□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 GEX2YKR106W 1848 nt7.65□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 KTI12YKL110C 942 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 SKI2YLR398C 3864 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YNL174WYNL174W 573 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YPR098CYPR098C 486 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 CDC13YDL220C 2775 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 HXT15YDL245C 1704 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 HXT16YJR158W 1704 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 MMT2YPL224C 1455 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 RPT2YDL007W 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 FUI1YBL042C 1920 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 NOP16YER002W 696 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 SUT1YGL162W 900 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 REI1YBR267W 1182 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 FOX2YKR009C 2703 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YBL044WYBL044W 369 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 SCW10YMR305C 1170 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 PGA2YNL149C 390 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 RRT2YBR246W 1164 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YDR514CYDR514C 1452 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YNL040WYNL040W 1371 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 YPL191CYPL191C 1083 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 NGR1YBR212W 2019 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 ECM10YEL030W 1935 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 HXT3YDR345C 1704 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1B-ORQ92393 ATR1YML116W 1629 nt7.59□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt7.59□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 NDE1YMR145C 1683 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 RSP5YER125W 2430 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 YOL075CYOL075C 3885 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 FPR2YDR519W 408 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 ECM23YPL021W 564 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 ATG26YLR189C 3597 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 SWI3YJL176C 2478 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 THP1YOL072W 1368 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 BSP1YPR171W 1731 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 PDI1YCL043C 1569 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 CLB1YGR108W 1416 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 RGS2YOR107W 930 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 UGA2YBR006W 1494 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 HFI1YPL254W 1467 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 HEM3YDL205C 984 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 BUD16YEL029C 939 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 SPL2YHR136C 447 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 YML101C-AYML101C-A 318 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 PFA3YNL326C 1011 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 TRM10YOL093W 882 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 YOR024WYOR024W 324 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 MAG2YLR427W 2013 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 PPM1YDR435C 987 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 HIR1YBL008W 2523 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 RFU1YLR073C 603 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 SIP2YGL208W 1248 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 CIA2YHR122W 696 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 RFC2YJR068W 1062 nt7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms