Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATAD2BQ8WXI9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms