Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKIN2Q8WXE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms