Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG1Q8WVM7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG1Q8WVM7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms