Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHDC4Q8TBB5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KLHDC4Q8TBB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLHDC4Q8TBB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms