Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD1Q8NHV4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms