Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK4Q8NE63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms