Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.1 ms