Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AVL9Q8NBF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms