Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIML1Q8N9V2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIML1Q8N9V2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIML1Q8N9V2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIML1Q8N9V2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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