Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPC2Q8N158 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC2Q8N158 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms