Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD3Q8N144 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD3Q8N144 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms