Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI4Q8N135 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms