Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC13Q8IYE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC13Q8IYE1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms