Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUDCD3Q8IVD9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD3Q8IVD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD3Q8IVD9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms