Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS9Q7Z410 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS9Q7Z410 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS9Q7Z410 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms