Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM15Q7Z3B0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM15Q7Z3B0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms