Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.557e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.417e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.37e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 215.8■□□□□ 0.127e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 215.64■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.077e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.047e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.027e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.027e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -07e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 DNM2-219ENST00000591818 538 ntTSL 413.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 213.39□□□□□ -0.277e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.277e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 310.96□□□□□ -0.657e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 213.86□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.61e-9■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.71■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.31■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.93□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.364e-14■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 G6PC3-204ENST00000588558 1718 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.414e-14■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 G6PC3-202ENST00000585361 1572 ntTSL 217.36■□□□□ 0.374e-14■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 G6PC3-205ENST00000590253 844 ntTSL 514.72□□□□□ -0.054e-14■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNHG6-204ENST00000521127 560 ntTSL 216.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 28
LARP4Q71RC2 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 HAX1-210ENST00000531435 1284 ntTSL 29.43□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 HAX1-209ENST00000492550 733 ntTSL 58.09□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 HAX1-205ENST00000459914 726 ntTSL 58.03□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.677e-8■■■■■ 27.9
LARP4Q71RC2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 27.8
LARP4Q71RC2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 27.8
LARP4Q71RC2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 27.8
LARP4Q71RC2 B4GALT3-207ENST00000470882 3178 ntTSL 511.75□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 27.8
LARP4Q71RC2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-31■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.394e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-206ENST00000470733 1453 ntTSL 215.37■□□□□ 0.054e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-207ENST00000474864 1029 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.284e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-205ENST00000462857 1260 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-209ENST00000495946 1203 ntTSL 212.89□□□□□ -0.354e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-208ENST00000482141 1199 ntTSL 212.83□□□□□ -0.364e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 NRM-204ENST00000444096 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.5□□□□□ -0.414e-14■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.441e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 216.72■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 AHSA1-207ENST00000555473 561 ntTSL 211.65□□□□□ -0.546e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 AHSA1-205ENST00000555133 1048 ntTSL 310.48□□□□□ -0.736e-9■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 LAMB2-212ENST00000484713 412 ntTSL 212.12□□□□□ -0.471e-15■■■■■ 27.7
LARP4Q71RC2 CDK2AP2-202ENST00000525402 1692 ntTSL 218.06■□□□□ 0.488e-10■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 CDK2AP2-204ENST00000531178 923 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.078e-10■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 517.42■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-204ENST00000586417 1752 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-208ENST00000588667 1619 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-211ENST00000589753 931 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-210ENST00000588972 632 ntTSL 58.43□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 ATG4D-202ENST00000585437 377 ntTSL 57.95□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 DSCR4-203ENST00000482032 799 ntTSL 34.83□□□□□ -1.644e-14■■■■■ 27.6
LARP4Q71RC2 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 27.5
LARP4Q71RC2 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 26.27□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 27.5
LARP4Q71RC2 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 27.5
LARP4Q71RC2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 LINC01606-204ENST00000519241 509 ntTSL 317.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 DNPH1-203ENST00000505042 396 ntTSL 211.29□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 27.4
LARP4Q71RC2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.659e-7■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 704.7 ms