Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP34Q70CQ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP34Q70CQ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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