Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYDE1Q6ZW31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYDE1Q6ZW31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms