Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP47Q6ZTR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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