Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBR3Q6ZT12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBR3Q6ZT12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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