Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF111Q6ZNA4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms