Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms