Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARM1Q6SZW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SARM1Q6SZW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms