Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms