Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms